Қойма (органелла)

Қойма немесе цитоплазмалық рибонуклеопротеин қоймасы химиялық рибонуклеопротеидтен тұратын эукариотты органелл. Электронды микроскоптың көмегімен бұл органеллалар 39-ретті симметрия осімен собор күмбезінің доғаларына ұқсайды [1]. Қойма қызметі жеткіліксіз түсініледі, бірақ қазіргі уақытта олардың әртүрлі жасушалық сигнал беру жолдарына қатысуы туралы ақпарат бар. Қойма антикантерлі химиотерапияға есірткіге қарсы тұрақтылықтың дамуына қатысуы мүмкін. Олар эукариотты жасушалардың көптеген түрлерінде кездеседі және эукариоттардың арасында өте жақсы сақталады. [2]
Мазмұны
1 Зерттеу тарихы
2 Қойылым құрылымы: 3 Функция
4 Клиникалық маңызы
4.1 Қатерлі ісік > 4.2 Инфекциялық аурулар - 5 Эволюциялық консервант
6 Ескерту: 7 Әдебиет және 8 Сыртқы сілтемелер
Зерттеу тарихы
Гель 1986 жылы жасуша биологы Нэнси Кедершпен тышқан бауырынан табылды және табысты оқшауланды. (Нэнси Кедершаның өмірбаяны) және биохимик Леонард Рим, Лос-Анджелестегі Калифорния университетінің медициналық мектебінде [3]. Бастапқыда қойма жұмыртқа тәрізді клатринмен байланысқан везикулалардың ластаушысы ретінде сипатталған. Бөлшектер сахарозаның тығыздығын градиент центрифугалау және агарозды гель электрофорезімен бөліп алды. Олардың готика соборының қоймаларына ұқсас симметриялы бөшке тәрізді құрылымы бар екендігі белгілі болды, сондықтан лобулалар өздерінің атауын алды (ағылшын тілінен - ​​қойма). Бастапқыда қойманың өлшемі 35 × 35 × 65 нм³ деп бағаланды, бірақ кейінірек ол криоэлектронды микроскоптың көмегімен 41 × 41 × 72,5 нм³ деңгейіне дейін нақтыланды. Осылайша, қойма - бұл бұрын-соңды сипатталған цитозолдық емес мозозедралды нуклеопротеидтердің ішіндегі ең үлкені. Болашақта қойманың құрылымын рентгендік дифракциялық талдау және ядролық магниттік резонанс зерттеді. 2009 жылы тінтуірдің бауыр қоймасының құрылымы 3,5 Å [4] деп анықталды.
қоймасының құрылымы - рибонуклеопроиннің ең үлкен бөлшегі. Көлемі бойынша олар рибосомадан асады және салмағы 13 мД [5]. Қойма ақуыздардан тұрады, сондықтан оларды стандартты әдістермен бояуды қиындатады. Қойманың ақуыз бөлігі негізгі бөлгіш ақуыздың (MVP) (95,8 кДа) көптеген молекулаларымен ұсынылған, олар бөлшектегі барлық ақуыздардың 70% -дан астамын құрайды [6], сонымен қатар TEP1 (∼192 кДа) протеиндері (∼192 кДа). 291 кДа). Сонымен қатар, қоймада ұзындығы 86-141 нуклеотидтерден тұратын сақиналы РНҚ (vRNA) болады [7]. Қоймадағы РНҚ-ның жалпы массасы 60460 кДа [4] деп бағаланады, қойма жиілігі шамамен 670 Å жетеді және максималды диаметрі ∼400 Å. Қабырғаның қалыңдығы бар болғаны 15–25; оның ішінде ұзындығы шамамен 620 and диаметрі ∼350 Å болатын қуыс бар. Бөлшек екі симметриялы жартыдан тұрады, олардың әрқайсысы үш бөліктен тұрады: дене, иық аймағы және қақпақ. Құрамында 9 қайталанатын MVP құрылымдық домендерінің 78 көшірмесі бар (әр жартысында 39 көшірме), R1 байланыстырылған аяғынан аяғына дейін құрылымдық қайталанатын домендердің нәтижесінде пайда болған шектелген бөлігі. Иық аймағының биіктігі ∼25 Å, диаметрі ∼315 Å. Қақпақтар бөлшектің екі жағында орналасқан және олардың әрқайсысында кап-спиральдың доменінің 39 данасы бар (амин қышқылы қалдықтары Асп647-ден Лей 802-ге дейін) және кап-шеңбердің домені (Gli803-тен Ala845-ке дейін) бар. Қақпақшаның биіктігі ∼155 Å, ал қақпақ шеңберінің ішкі және сыртқы диаметрлері тиісінше ∼50 Å және ∼130 Å құрайды [4].
MVP
MVP құрылымы 9 қайталанатын құрылымдық домендерден тұрады (R1-R9). R8 және R9 домендері S1, S2, S3, S4 және S5 тағайындалған бес параққа қарсы парақтардан тұрады. Қалған жеті доменде S2 және S3 аралықтарында екі қосымша парақ бар (S2a және S2b). Кейбір мәліметтерге сәйкес, R1, R8 және R9 сияқты, бес параққа параллель парақтардан тұрады, ал R2-де S2 мен S3 арасындағы екі параққа қарсы парақтар бар. Әрбір доменнің гидрофобты әсері бар. Аминоқышқылдар тізбегін талдау R3 және R4-тің «EF қолы» типіндегі екі доменге ие болуы мүмкін екенін көрсетті. Қосымша зерттеу көрсеткендей, MVP ақуыздармен, мысалы, PTEN-мен, кальций иондары қатысатын екі EF қол домендерімен әрекеттесетіндігін көрсетті, бірақ барлық тәжірибелік мәліметтер бұған сәйкес келмейді [4]. Иық (Pro520-ден Val646-ге дейін). бір α / β-глобулярлы доменге бір жағында 4 параққа қарсы бета парақтары, екінші жағында 4 α-спиральдар түседі. Әлбетте, иық аймағында қойманың липидті сөрелермен өзара әрекеттесуіне жауап беретін элементтер бар [4] .. Кап-спиральдың домені 42 айналымнан тұратын α-спиральға бүктелген, ол суперкоилге сәйкес келеді. Қақпақ шеңберінің домені қақпақшаның соңында орналасқан және U-тәрізді құрылымды екі ұшында дөңгелек элементтері бар [4] құрайды.ВРНҚ-лар қақпақ бөлшектерінің ұштарындағы қақпақтарда орналасады. ТЭП1 ақуызы, қақпақтың жалпақ бөлігінің жоғарғы жағында орналасқан, онда оның WD40 қайталануы [en] домалақ тәрізді қоздырғыштың құрылымын құрайды. TEP1-нің N-терминалды бөлігінде белгісіз функционалды мақсаттағы 4 қайталанатын домен, RNA байланыстырушы домен және ATP / GTP байланыстырушы домен бар. TEP1 теломераза РНҚ және адамның әртүрлі вРНҚ-мен әрекеттесетіні көрсетілген. VPARP негізінен қойма қақпағында орналасқан [4]. Құрамдас бөлшегі
Мазмұны
Локус - Қойма орналасуы және өзара әрекеттесуі - MVP функциялары
ақуыздың 96 данасы қойманың негізгі бөлігін құрайды. Қоймаға өздігінен жинай білу. Қоймадан тыс функция болмауы керек - 16p11.2 - корпус пен қақпақ қоймасынан, серіктестер қажет емес - құрылымдық; Белсенді ақуыздың байланыстырылуын бақылайды - VPARP - әлсіз поли (ADP-рибоза) -полимераза, тек жартылай байланған
13q11
қақпақ, MVP N-терминалды бөлігіне тікелей байланыстырады Каталитикалық: Poly (ADP) MVP - TEP1 рибоссилациясы - теломераза мен қоймаға байланысады; Теломераза үшін талап етілмейді - 14q11.2
MVP
каталитикке тікелей байланыстыратын қақпақ: vRNA нысандарын қойнауқатқа
vRNA
hgv1-3, hgv4 жинақталмайды; Қоймаға ішінара байланысты
5q33.11
Xp11.22
ТЭП1-ге байланысты, құрылымдық емес, функциялары нашар түсінілген
Функциялар
Кең таралған қойма және олардың эволюциясы консерватизм бұл органеллаларда маңызды биологиялық функциялардың болуының пайдасын көрсетеді, дегенмен олар туралы аз мәлімет бар. Протистердің жасушаларында бастапқы қойма функциялары туралы ештеңе білмейді. Сүтқоректілер жасушаларындағы қойма рөліне қатысты бірнеше теория бар. Солардың ішінде, организмнің тазаруына байланысты жасушалар мен тіндерде, мысалы, макрофагтарда, өте көп мөлшерде қоршау бар екендігі айтылған. Сонымен қатар қойма ядролық кеуек кешендеріндегі негізгі «қыртыстар» болып табылады деген болжам бар. Қимылға қарсы антиденелерді қолдана отырып, иммунофлуоресценттік талдау мышықтың бауыр жасушаларының оқшауланған ядроларында қойма тышқандары ядролық мембрананың бетінде орналасқандығын көрсетті. Иммуноэлектронды микроскопия Аврора-мен біріктірілген қайталама антиденелерді қолдана отырып, оқшауланған ядроларда қойманың ядролық кеуек комплекстерімен байланысты екенін көрсетті. Сондықтан қойма ядролық цитоплазмалық тасымалдауға қатысуы мүмкін 2005 жылы адамның vvRNA hvg1 және hvg2 антиоксидант есірткі митоксантонына байланыстыруы мүмкін және улы қосылыстардың экспорты кезінде маңызды рөл атқарады деген болжам жасалды. Алайда, тағы бір зерттеу тышқандардағы MVP гендік белсенділігінің цитостатикалық препараттарға сезімталдықты жоғарылатуға әкелмегені анықталды. Сонымен қатар, жабайы түрдегі тышқандар мен ақаулы тышқан MVP доксорубицинге бірдей реакция көрсетті. Тағы бір зерттеу MVP-нің ұсақ кедергі келтіретін РНҚ-мен бұзылуы доксорубициннің ядродан шығарылуына әсер етпегенін көрсетті. Сонымен қатар, химосенциалды жасушалардағы MVP өрнегінің жоғарылауы дәріге төзімділікті арттырмады. Бұл нәтижелер MVP және қойма цитостатикалық агенттерге қарсы тұруға тікелей ықпал етпейтіндігін көрсетеді.
Бірқатар зерттеулер жасушалардың сигнал беру жолдарының әртүрлі аймағында орналасқандығын және мұндай жолдардың саны үнемі өсіп келе жатқандығын көрсетті. Ашытқы екі-гибридті жүйе MVP PTEN-ге, фосфатидилиноситол-3,4,5-трифосфатты фосфорилаттайтын, фосфоинозитид-3-киназалық SHP-2, оның құрамында SHP-2 киназасы бар, протеиннің протеинімен байланысатындығын көрсетті. (Src гомологиясы 2) және эпидермальды өсу факторында (EGF) сигналдық жолдағы ақуыздық ақуыз ретінде қызмет етеді. ТЭЦ-2 тирозиннің қалдықтарымен фосфорланған MVP-мен байланысатындығы анықталды және бұл байланыстыру EGF күшейтілді. Осылайша, MVP SHP-2 және жасушаішілік реттелетін киназаларға арналған ақуыздық ақуыз функциясын атқарады және SHP-2 арқылы MVP фосфорлануын реттеу жасушаның тіршілігі үшін маңызды болуы мүмкін. Сонымен қатар, MVP мен SH2 Src доменінің адамның асқазан жасушаларында және 253J асқазан обыры жасушаларында өзара әрекеттесуі көрсетілген. Иммунопретация және иммунофлуоресценттік талдау EGF MVP мен Src арасындағы әрекеттестікті күшейтіп, оны Src PP2 ингибиторымен блоктады, EGF сонымен қатар MVP-нің ядродан гиалоплазмаға және цитоплазманың нуклеолярлы аймағына өтуін ынталандырды. SRc-дегі сигнал беру сатыларының жаңа реттеушісі ретіндегі MVP рөлі туралы болжамдар бар. MVP интерферон IF (IFN-γ) тудыратын ақуыз екендігі анықталды: IFN-γ-ге жауап ретінде мРНҚ мен MVP ақуызының деңгейінің едәуір жоғарылауы байқалды. Бұл белсендіру STAT1 мен IFN-γ проксималды MVP қараудағы сайттың өзара әрекеттесуіне қатысады. Сонымен қатар, IFN-M MVP аудару жылдамдығын едәуір арттырды. Қойма эстрадиолмен байланысқан кезде эстрогендік рецепторлармен әрекеттесе алатындығы және рецепторлармен бірге ядроға тасымалдана алатындығы көрсетілген. Мәліметтердің біріне сәйкес қойма мен MVP инсулинге ұқсас HIF1A өсу факторымен өзара әрекеттесе алады, сонымен қатар ДНҚ-ның екі қатарлы үзілістерін қалпына келтіру процестерін тежейді: гомологиялық емес ұшы және гомологиялық рекомбинациясы. Осылайша, қойма бөлшектері жасушаның сигналдық каскадтарында өзара әрекеттесудің орталық платформасы ретінде қызмет етеді. VRARP, тағы бір ақуыз - бұл поли (ADP рибозы) полимераза.
Қабаттың ерекше құрылымы мен ерекше динамикасы, және олардың үлкен мөлшері қойманың ксенобиотиктер, нуклеин қышқылдары мен ақуыздарға арналған табиғи наноконтейнерлер ретінде қызмет ете алатындығын болжайды. Рекомбинантты қойманы, атап айтқанда қойманың жасуша беті рецепторларымен өзара әрекеттесуін және әртүрлі жүктердің енуін қамтамасыз ету бойынша жұмыстар жүргізілуде.
Кестеде қоймамен әрекеттесетін ақуыздар туралы негізгі ақпарат жинақталған:
Protein


Локус - қоймамен өзара әрекеттесу - PTEN - PI3K жолының негізгі ингибиторлық фосфатазасы - PTEN
ісік сығындысы. PIP3 негізгі субстраты - 10q23.3 - MVP (N-Terminus), Ca2 + -бақытты өзара әрекеттесу - ядролық функцияны күшейту PTEN - SHP-2 - ақуыз тирозин фосфатазасы; рецепторлардың тирозиндік киназаларымен (РТК) делдал болған рецепторлық активатор - Эрк2 - Митоген-тирозин киназын белсендіре отырып, EGRF-арқылы MAPK белсенділігін ынталандыру; 22K11.22
РТК-мен таратылатын тарату сигналдарының мастер-таратқышы - SRc (Proto) онкогенінің, тирозин киназасының EGRF-мен MAPK белсенділігін ынталандыру 20q11.2 - MVP (Фосфорлану-тәуелді MVP-нің өзара әрекеттесуі) - COP1 - E3 уикипитин лигазасы бойынша EGRF-дегі MAPK әрекетін ынталандыру, омыртқалыларда c-Jun және p53 бұзады
1q25.1 - 1q25 .2 - MVP (азайтылған UVP-нің фосфорлануы) - MAPK-тің EGF-арқылы белсендірілуін басады - Эстроген рецепторы - Эстрадиол гормонының ядролық рецепторлары мақсатты гендердің мақсатты транскрипциясы - 6q25.1
MVP (гормонға тәуелді өзара әрекеттесу)
Ядролық импорт және эстроген рецепторының белсенділігі - La RNA байланыстыратын ақуыз
3'-терминалды байланыстырады және қорғайды РНҚ полимераза III синтезделген UUU (OH) транскриптінің элементтері
2q31.1
vRNA
vRNA қорғау
Клиникалық маңызы - Қатерлі ісік 1990 ж. қойма қатерлі ісік жасушаларында есірткіге қарсы тұрақтылықтың дамуына тікелей қатыса алады. LRP деп аталатын бірнеше қарсылықты ақуыз (өкпенің төзімділігіне байланысты протеин - өкпенің төзімділігіне байланысты протеин) - бұл іс жүзінде адамның MVP. Екінші зерттеу барысында адамның SW-620 ішек қатерлі ісігі жасушаларында резервуар мен есірткіге төзімділігі арасындағы байланыс көрсетілді. SW-620 натрий бутиратымен емдеу MVP өрнегін жоғарылатып, доксорубицинге, винкристинге, грамицидин D мен паклитакселге төзімді болды. Бұл әрекетті тежейтін MVP-рибозималары бар жасушаларды трансфекциялау.ВРНҚ-да дәрі-дәрмектің бірнеше қарсыластығының дамуына ықпал етуі мүмкін. 2009 жылы кодталмаған вРНҚ-ны «Dicer» қатысуымен ұсақ вРНҚ (свРНҚ) өңдей алатындығы анықталды, ол әрі қарай РНҚ тәрізді микроРНҚ-лармен жұмыс істейді: свРНҚ-лар Argonaute тұқымдас ақуыздарымен байланысады және CYP3A4 өрнегін теріс реттейді, Ксенобиотикалық метаболизмге қатысады.
Соңғы жылдары резервуардың жасушадағы ДНҚ-ны қалпына келтіру жүйелерінің жұмысымен байланысты екендігі туралы мәліметтер жинақталуда, сондықтан олар химиотерапияға ғана емес, сонымен қатар қатерлі ісік ауруының радиациялық терапиясына да бейімділікке ықпал етуі мүмкін.

Жұқпалы аурулар 2007 жылы екі зерттеу тобы инфекцияларға жауап ретінде табылғанын хабарлады. Эпштейн-Барр вирусын жұқтырған адамның В-лимфоциттерінде вирустардан және / немесе тасымалдау механизмдерінен қорғауға қатысатын вРНҚ деңгейі жоғарылағаны белгілі болды. Сонымен қатар, адамның эпителийлік өкпе жасушаларына жұқтырған кезде, Pseudomonas aeruginosa MVP шыбыны липидті сөрелерге тез тартылып, ол туа біткен иммундық реакцияны күшейту тетіктеріне қатысады. MVP - / - тышқандарда жабайы типтегі тышқандарға қарағанда өкпе тіндеріне бір грамнан 3,5 есе көп бактериялар пайда болды, және көбінесе Pseudomonas aeruginosa тудырған инфекциядан қайтыс болды. Эволюциялық консервативті - Vault сүтқоректілерде, қосмекенділерде, құстарда сипатталған , сонымен қатар Dictyostelium discoideum шырышты қабатында болады [2]. Pfarm мәліметтер базасынан алынған мәліметтерге сәйкес парамеций тетраурелиясының, кинетопластидтің, көптеген омыртқалылардың, Нематостелла веттенсисінің, моллюскалардың, ламелалардың, жалпақ құрттардың инфузиясында табылған ақуыздардың гомологтары (мысалы, эхинококк 8), Қойма ақуызының гомологтары бірқатар эукариотты организмдерде анықталмады. Олардың қатарына Рузушка Тал өсімдігі, Caenorhabditis elegans нематоды, Drosophila қара шыбыны және сыра ашытқысы сияқты модельді организмдер жатады [9]. Алайда, осы ерекшеліктерге қарамастан, әртүрлі ағзалардағы қабаттардың ұқсастығының жоғары деңгейі бұл органеллалардың белгілі бір эволюциялық мәнге ие екендігін көрсетеді [2]. Соңғы мәліметтерге сәйкес, эукариоттардың соңғы ортақ бабасы сақталған, бірақ кейіннен олар көптеген топтарға, соның ішінде саңырауқұлақтарға, жәндіктерге және мүмкін өсімдіктерге жоғалды [10].
Ескертпелер
↑ PMID 19150846 (PubMed)
↑ PMID 2943744 (PubMed) - Сілтеме бірнеше минуттан кейін автоматты түрде аяқталады. Кезекпен секіріңіз немесе қолмен кеңейтіңіз. Танака Х., Цукихара Т. Ірі нуклеопротеинді бөлшектерді, қоймаларды құрылымдық зерттеу.
↑ Kedersha N. L., Heuser J. E., Chugani D. C., Rome L. H. Vault.
↑ PMID 10477748 (PubMed)
Сілтеме бірнеше минуттан кейін автоматты түрде аяқталады. Кезекпен секіріңіз немесе қолмен кеңейтіңіз. ↑ van Zon A., Mossink M. H., Scheper R. J., Sonneveld P., Wiemer E. A. The қойма кешені.
↑ Пфам: Отбасы: Қойма (PF01505). pfam.xfam.org. Сілтеме 2016-01-09.

Рим, Л .; Кедерша, Н .; Чугани, Д. (1991-08-01). Құлыпты қоймалар: функцияны іздеудегі органеллалар. 1-жасушалық биологиядағы тенденциялар (2-3). б. 47–50. ISSN 0962-8924. PMID 14731565. дәйексөз 2016-01-09.
↑ Дали, Тони К .; Сазерленд-Смит, Эндрю Дж .; Пенни, Дэвид (2013-01-01). Негізгі қойнауындағы ақуыздың кремнийлі қайта тірілуі бұл ата-баба және қазіргі эукариоттар дегенді білдіреді. Геном биологиясы және эволюциясы 5 (8). б. 1567–1583. doi: 10.1093 / gbe / evt113. ISSN 1759-6653. PMC 3762200. PMID 23887922. Сілтеме 2016-01-09.
Әдебиет: Рим Л. Х., Киххофер В. А. Қойма бөлшектерін платформа технологиясы ретінде дамыту. Рейс Е.В., Перейра Р.В., Гомес М, Жаннотти-Пассос Л.К., Баба Е.Х., Коэльо П.М., Маттос А.С., Коуто ФФ, Кастро-Боргс В., Герра-Са Р. адам паразитінің өмірлік циклі кезінде Schistosoma mansoni. Касасас А., Керол-Ауди Дж., Гуерра П., Пус Дж., Танака Х, Цукихара Т., Вердагер Н., Фита И. Роман ашқан қойма архитектурасы мен динамикасының жаңа ерекшеліктері деформацияланатын серпімді желі тәсілін қолдану арқылы нақтылау. Сыртқы сілтемелер - Vault веб-торабы (UCLA).
MeSH Vault + Рибонуклеопротеин + Бөлшектер




Жасуша құрылымы / Жасуша органеллалары - Ядро (және ядро) · Цитоплазма · Цитозол - Эндомембрана жүйесі - Жасуша мембрана · Ядролық мембрана · Эндоплазмалық ретикулум · Гольджи кешені
Везикулалар: вакуум · контракті вакуоль · лизосома · фагосома · фаголизосома · эндосома · экзосома · меланосома · пероксисома · цитосекро · цитосекро · цитосекрота Аралық жіпшелер · Миофибриллалар · Прокариоттардың цитоскелеттері - Микротубулаларды ұйымдастыру орталығы: Центросома / Центриол · Базальды Тавр · Флагелла / Жатыр мойны · Ахонема - Эндосимбионттар - Митохондрия (Митохондриялық рибосома) · Пластидтер: Хлоропласт · Лейкопласт · Хромопласт · Пропластида · Басқа ішкі құрылымдар · Рибосома · Рибосома · Рибосома Қойма · Экзосома (күрделі) - сыртқы құрылымдар - жасуша қабырғасы


Vault (органела)

Випадкові Статті

Мале Ситно

Мале Ситно

село Мале Ситно біл Малое Сітна Основні дані 55°41′39″ пн ш 29°21′23″ с...
Бабуняк Ярослав Іларіонович

Бабуняк Ярослав Іларіонович

Бабуняк Ярослав Іларіонович (2 січня 1924, село Вербів, нині Бережанського району Тернопільської...
Пелагія Каленикович

Пелагія Каленикович

Пелагія Ничипорівна Каленикович д/н —1699 — перша дружина Івана Скоропадського до отриманн...
Альмонасід-дель-Маркесадо

Альмонасід-дель-Маркесадо

Альмонасід-дель-Маркесадо ісп Almonacid del Marquesado — муніципалітет в Іспанії, у складі авто...