Thermus aquaticus

Thermus aquaticus - гэта тып грамотріцательных бактэрый, вядомы сваёй здольнасцю вытрымліваць высокія тэмпературы. Thermus aquaticus - адзін з некалькіх тэрмафілаў групы Deinococcus-Thermus. Дзякуючы гэтаму была выдзелена цепластойкая ДНК-полімераза Taq, якая ў наш час шырока выкарыстоўваецца для ланцуговай рэакцыі полімеразы і з'яўляецца адным з найважнейшых ферментаў у малекулярнай біялогіі. Гэтая бактэрыя насяляе ў гарачых крыніцах нацыянальнага парку Елаўстон і іншых падобных рэгіёнах, уключаючы гейзеры пры тэмпературы вышэй за 55 ° С. Бактэрыя была выяўленая Томасам Брокам і Хадсанам Фрызам у Вялікіх фантанах Елаўстонскага парку.
Змест - 1 Біялагічныя ўласцівасці - 1.1 Марфалогія і метабалізм - 1.2 Геном
2 Тэрмастабільныя ферменты - 2,1 альдолаза - 2,1 РНК-полімераза - 2,3 танк1-рэстракцыйны фермент 2,4 так-полімераза - 3 спасылкі - Біялагічныя ўласцівасці - Марфалогія і метабалізм
Т. aquaticus - грамотріцательных бактэрыя ў форме палачкі. Ён не ўтварае капсулы і спрэчкі, некаторыя штамы рухомыя і маюць жгуцікі. На сонечным святле выпрацоўваюцца розныя пігменты [1]. Надзвычай цеплалюбівы хемоорганогетеротроф, аэробны [2], развіваецца пры тэмпературы вышэй 55 ° С (аптымальная 70 ° С). Жывучы ў гарачых крыніцах, гейзерах [3], два штамы былі выдзелены з гарачай вадаправоднай вады [4]. Геном
род T. aquaticus штаму HB27 прадстаўлены колцападобнай храмасомай 1894877 пар падстаў і мегаплазмы pTT27 з 232605 пар падстаў. Адзначана вялікае падабенства геніяльнага T. aquaticus з геномам мезафільнага арганізма Deinococcus radiodurans [5]. Парадкаванне і аналіз генома штаму Y51MC23, памер храмасомы якога складае 2340768 пар падстаў, храмасома змяшчае 2570 генаў, з якіх 2520 кадуюць вавёркі, утрыманне HC складае 68% [6]. T, акварыум штаму NTU103 мае плазміду pTA103 памерам з базавых пар 1965, якая паўтараецца па прынцыпе кольца [7]. T. aquaticus заражаецца бактэрыяфагам IN93, геном якога прадстаўлены двухстворчатай кольцавой малекулай ДНК пары базаў 19603 года [8].
Термостабильные ферменты
T. акватыкус - надзвычай цеплалюбівая бактэрыя, таму яго ферменты тэрмастабільныя і не павышаюцца пры павышанай тэмпературы. Некаторыя ферменты T. aquaticus (рэзістэнтнасць фермента Taq1 і, асабліва, полимераза Taq) шырока выкарыстоўваліся ў якасці інструментаў для малекулярна-біялагічных і генетычных даследаванняў [9]. Альдолаза
Першапачаткова было незразумела, як T. aquaticus можа выжыць у экстрэмальных тэмпературных умовах. таму неабходна было падрабязна вывучыць ферменты T. aquaticus, у прыватнасці, як пазбегнуць дэнатурацыі пры такіх высокіх тэмпературах. Адным з першых вывучаных ферментаў Т. aquaticus была альдалаза [10]. РНК-полімераза. Першай палімеразай, выдзеленай з T. aquaticus, была РНК-полімераза (транскрыптаза), упершыню атрыманая ў 1974 г. [11]. Пазней былі праведзены крышталаграфічныя даследаванні гэтага фермента [12], пасля чаго з яго была створана рэкамбінантная РНК-полімераза, прызначаная для малекулярна-біялагічных даследаванняў транскрыпцыі [13].
Taq1-рестриктаза
фермент рестрикции Taq1 (Taq1-рестриктаза) быў адзін з першых ферментаў T. aquaticus, які выкарыстоўваецца для малекулярна-біялагічных даследаванняў [14]. Яго вобласць абмежавання - TCGA.
Taq Polymerase
Больш падрабязна: Taq Polymerase
Taq Polymerase была ўпершыню выдзелена ў 1976 годзе [15]. Перавагамі гэтай палімеразы для біятэхналогій перад палімеразамі іншых арганізмаў з'яўляецца магчымасць працаваць пры падвышанай тэмпературы (аптымальна 72-80 ° С) і магчымасць атрымліваць гэтую палімеразу ў чыстым выглядзе. У 1986 годзе Кары Муліс вырашыў выкарыстаць полимеразу Taq для ланцуговай рэакцыі полимеразы (ПЦР), якую ён распрацаваў у 1983 годзе, улічваючы, што палімераза вытрымала высокую (94-96 ° С) тэмпературу, неабходную для дэнатурацыі ДНК. , з-за чаго не трэба было ўводзіць новую порцыю дарагой ДНК-полімеразы пасля кожнага цыклу ўзмацнення. Пазней ген полимеразы Taq быў кланаваны і зменены для атрымання высокаэфектыўнага камерцыйнага прадукту [16]. Гэтая палімераза гамалагічная ДНК-полімеразе I (pol I) кішачнай палачкі [17]. Палімераза Taq таксама абмежавана выкарыстоўваецца ў паслядоўнасці ДНК [18], але з-за вялікай колькасці палімераў [19] (з-за адсутнасці 3'-5 'экзонуклеазы актыўнасць), у паслядоўнасці і дакладным аналізе часцей выкарыстоўваецца полимераза Pfu з археі Pyrococcus furiosus [20] (хаця полімераза AmpliTaqR мае перавагу перад ПМФ-полімеразай з-за высокай працэсіўнасці [21]). (1970). Тонкая структура Thermus aquaticus, экстрэмальны тэрмафіл. Часопіс бактэрыялогіі 104. с. 509—517. PMID 5473907.
↑ Клінтан А. Кэнэдзі. Мікрабіялогія Thermus aquaticus ізалявана ад гарачых крыніц Вулкан, Каскад, штат Айдаха. Архіў арыгінала за 2013-06-26.
↑ Брок Т. Д., Х. Freeze (1969). Thermus aquaticus gen. н. і сп. н. і неспартуючых экстрэмальных тэрмафілаў. Часопіс бактэрыялогіі 98. с. 289—297.
↑ Pask-Hughes R, Williams RA (1975). Надзвычай цеплалюбівыя грамотріцательных бактэрыі з гарачай вадаправоднай вады. J Gen Microbiol. 88 (2). р. 321–8. PMID 1097586.
↑ Henne A, Brüggemann H, Raasch C, Wiezer A, Hartsch T, Liesegang H, Johann A, Lienard T, Gohl O, Martinez-Arias R, Jacobi C, Starkuviene V, Schlenczeck S, Dencker S , Huber R, Klenk HP, Kramer W, Merkl R, Gottschalk G, Fritz HJ. Паслядоўнасць генома экстрэмальнага тэрмафіла Thermus thermophilus. Nat Biotechnol. 22 (5). р. 547–53. PMID 15064768. Невядомы параметр праігнараваны | yea = (дапамога)
↑ Thermus aquaticus Y51MC23, незавершаная паслядоўнасць, праект паслядоўнасці цэлага генома драбавікоў NCBI
↑ Чу SF, Шу HY, Лін ЛК, Чэнь Май, Цэй СС, Лін Г.Х. (2006). Характарыстыка плазміды рэплікацыі кругавога кола з Thermus aquaticus NTU103. Плазміда. 56 (1). р. 46–52. PMID 16675012.
↑ Thermus phage IN93, поўны геном NCBI
↑ http://www.vivo.colostate.edu/hbooks/genetics/biotech/enzymes/hotpolys.html
↑ Freeze H., Brock ГД Термостабильная альдолаза з Thermus aquaticus // J. Бакт. 1970, вып. 101 (2), с. 541—550
↑ Air G.M., Harris J.I. ДНК-залежная РНК-полімераза ад цеплафільнай бактэрыі Thermus aquaticus // FEBS Лісты 1974, вып. 38 (3), с. 277—281
↑ http://www.aps.anl.gov/Science/Reports/1999/darsts2.pdf
↑ http://jb.asm.org/cgi/content/ab Abstract/183/ 1/71
↑ Sato S. Аднаразовае расшчапленне ДНК віруса Simian 40 (SV40) дзякуючы сайт-спецыфічнай эндануклеазе ад Thermus aquaticus, Taq I // J. Biochem (Tokyo), 1978, 83 (2), R. 633
↑ http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&amp ;pubmedid=8432
↑ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8324500
↑ http://www.nature.com/nature/journal/v376/n6541/abs/376612a0.html
↑ http://www.pnas.org/content/85/24/9436.abrief
↑ http://findarticles.com/p/articles/mi_qa3874/is_200001/ai_n8886522
↑ http://web.archive.org/web/20071020001733/http://www.sciam.ru/2006/5/ Sciencerf.shtml
↑ http://molbiol.ru/protocol/09_07.html
Гэта недапрацаваны артыкул аб бактэрыялогіі.
Вы можаце дапамагчы праекту, выправіўшы або дадаўшы яго.


Thermus aquaticus

Випадкові Статті

Apollonias zeylanica

Apollonias zeylanica

Apollonias zeylanica — це вид квіткових рослин роду Аполонії родини Лаврових Зміст 1 Морфо...
Підрозділ (значення)

Підрозділ (значення)

Підрозділ: Підрозділ військова справа Команда Департамент підрозділ Підрозділ — поняття, яке ма...
Звіробій (фільм, 1990)

Звіробій (фільм, 1990)

«Звіробі́й» — художній фільм у двох серіях 1990 за мотивами однойменного роману Дж Ф Купера ...
Ольденборстель

Ольденборстель

Ольденборстель нім Oldenborstel — громада в Німеччині, розташована в землі Шлезвіг-Гольштейн Вх...