Пи-спираль

Пи-спираль (или π-спираль) - вид вторичной структуры, иногда образуется в белках.
Обычная структура
Аминокислоты в обычной π-спирали устраиваются в правосторонней спиральной структуре. Каждая аминокислота соответствует повороту спирали на 87 ° (то есть, спираль имеет 4,1 остатков на виток), и имеет длину 1,15 Å (= 0,115 нм) вдоль оси спирали. Важной особенностью структуры является то, что аминогруппа одной аминокислоты формирует водородную связь с C = O группой аминокислоты на пять остатков ранее, эти повторные i + 5 → i водородные связи определяют π-спираль. Подобные структуры включают 310-спираль (i + 3 → i водородная связь) и α-спираль (i + 4 → i водородная связь).
Вид сверху тт-спирали. Четыре карбоксильные группы, указывают вверх в направлении к зрителю, расположенные примерно под углом 87 ° друг относительно друга на круге, отвечая 4,1 аминокислотных остатков на оборот спирали.
Остатки в π-спиралях обычно примите (φ, ψ) двугранный угол (-55 °, -70 °). Более всего, они принимают двугранные углы таким образом что угол ψ одного остатка и угол φ следующего имеют сумму примерно -125 °. Для сравнения, сумма соответствующих углов для 310-спирали составляет около -75 °, тогда как для α-спирали составляет около 105 °. Общая формула для углу вращения Ω на остаток любой полипептидной спирали с трансизомерами задается уравнением:



3
cos
& # x2061;
& # x03A9;
= 1
& # x2212;
4

cos

2


& # x2061;

[

(
& # x03D5;
+
& # x03C8;
)


/

2
]



{ displaystyle 3 cos Omega = 1-4 cos ^ {2} left [ left ( phi + psi right) / 2 right ]}

Ливозакручена структура
В принципе, возможна ливозакручена версия π-спирали, изменяя зн ак двугранного углу (φ, ψ) на (55 °, 70 °). Эта псевдо "зеркальная" спираль имеет примерно то же число остатков на оборот (4,1) и шаг спирали 1,5 Å. Однако эта структура не является действительным зеркальным отражением, потому что аминокислотные остатки все еще имеют левую хиральность. Длинная ливозакручена π-спираль вряд наблюдается в белках, так как среди природных аминокислот только глицин способен принимать положительный угол φ.
Ссылка
Pauling L, Corey RB and Branson HR. (1951) «The Structure of Proteins: Two Hydrogen-Bonded Helical Configurations of the Polypeptide Chain», Proc. Nat. Acad. Sci. Wash., 37, 205.
Это заготовка статьи по биохимии.
Вы можете помочь проекту, исправив и дополнив её.


Пі-спіраль

Випадкові Статті

Ophidion scrippsae

Ophidion scrippsae

Ophidion scrippsae — вид риб родини Ошибневих Ophidiidae Поширений у східній Пацифіці від Пойнт...
Комар Володимир Степанович

Комар Володимир Степанович

Медіафайли у Вікісховищі У Вікіпедії є статті про інших людей з прізвищем Комар Володимир Ст...
1 липня

1 липня

1 липня — 182-ий день року (183-ий в високосні роки) в григоріанському календарі. До кінця року...
Хачеріді Євген Григорович

Хачеріді Євген Григорович

* Ігри та голи за професіональні клуби враховуються лише в національному чемпіонаті. Інформацію поно...