Фрагменты Оказаки

Фрагменты Оказаки (англ. Okazaki fragments) — относительно короткие фрагменты ДНК (с РНК-праймером на 5' конце), которые образуются на отстающей цепи в процессе репликации ДНК. Длина фрагментов Оказаки у E. coli составляет около 1000—2000 нуклеотидов, и обычно 100—200 нуклеотидов у эукариот.

Фрагменты Оказаки были описаны в 1968 году Рэйдзи Окадзаки[en], Тсунэко Окадзаки[en] и их соавторами при изучении репликации ДНК бактериофага у кишечной палочки[1][2].

Механизм

Схема репликации ДНК

Каждый фрагмент Оказаки образуется рядом с репликационной вилкой после РНК-праймера, образуемого праймазой, и далее продолжается ДНК-полимеразой III в случае прокариотов. У эукариотов отстающая цепь синтезируется ДНК-полимеразой δ. Праймер позднее удаляется ферментом с эндонуклеазной активностью подобной РНКазе H[en], flap-эндонуклеазе[en] и геликазе/нуклеазе DNA2L[en].

Примечания

↑ Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K. Mechanism of DNA replication possible discontinuity of DNA chain growth. Jpn J Med Sci Biol. 1967 Jun;20(3):255-60.
↑ Ogawa T, Okazaki T, Discontinuous DNA Replication. Annu. Rev. Biochem. 49:421-457, 1980

Литература

Inman RB, Schnos M, Structure of branch points in replicating DNA: Presence of single-stranded connections in lambda DNA branch points. J. Mol Biol. 56:319-625, 1971.
Thommes P, Hubscher U. Eukaryotic DNA replication. Enzymes and proteins acting at the fork. Eur. J. Biochem. 194(3):699-712, 1990.

Репликация ДНК

Инициация

Прокариоты	Пререпликационный комплекс Хеликазы (DnaA[en] • DnaB • T7[en]) Праймаза (DnaG)

Эукариоты[en]	Пререпликационный комплекс Комплекс распознавания Ori[en] (ORC1[en] • ORC2[en] • ORC3[en] • ORC4[en] • ORC5[en] • ORC6[en]) • Cdc6[en] • Cdt1[en] Комплекс обслуживания минихромосом[en] (MCM2[en] • MCM3[en] • MCM4[en] • MCM5[en] • MCM6 • MCM7[en]) Разрешающий фактор[en] Автономно реплицирующаяся последовательность Белки, связывающие одноцепочечную ДНК (SSBP2[en] • SSBP3[en] • SSBP4) • РНКаза Н[en] (RNASEH1[en] • RNASEH2A[en]) Хеликазы: Mcm2-7 Праймаза: ДНК-полимераза α

Общее для про- и эукариот	Точка начала репликации/Репликон Репликационная вилка (отстающая и лидирующая цепи) • Фрагменты Оказаки • Праймер

Элонгация

Прокариоты	Холофермент ДНК-полимеразы III (dnaC • dnaE[en] • dnaH[en] • dnaN[en] • dnaQ[en] • dnaT[en] • dnaX[en] • holA[en] • holB[en] • holC[en] • holD[en] • holE[en]) • реплисома[en] • лигаза • Белки скользящей застёжки • Топоизомераза (ДНК-гираза) ДНК-полимераза I[en] (фрагмент Кленова)

Эукариоты	Репликационный фактор С[en] RFC1 • колеблющиеся эндонуклеазы[en] (FEN1[en]) • Топоизомераза • Репликативный белок А (RPA1[en]) ДНК-полимераза δ[en] (POLD1[en] • POLD2[en] • POLD3[en] • POLD4[en]) Белки скользящей застёжки (PCNA[en])

Общее для про- и эукариот	Процессивность • лигаза

Терминация

Теломеры: теломераза (TERT[en] • TERC[en] • DKC1[en])

Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Вы можете помочь проекту, дополнив её.