Sat . 19 Dec 2019

D-аланин - D-аланин лигазы

Энзимологияда D-аланин - D-аланин лигаза EC 6324 - ATP + 2 D-аланиннің химиялық реакциясын катализдейтін фермент


& # x21CC;




ADP + фосфат + D-аланил-D-аланин
Осылайша, осы ферменттің екі субстраты - АТФ және Д-аланин, ал оның 3 өнімі - АДФ, фосфат, және D-аланил-D-аланин - Бұл фермент, атап айтқанда, қышқыл-D-аминқышқылды лигаздар пептид синтазалары ретінде көміртегі-азоттық байланыс түзетін лигаздар тобына жатады. Бұл фермент класының жүйелік атауы D-аланин: D-аланин-лигаза ADP-түзуші Жалпы қолданыстағы басқа атауларға аланин жатады: аланин-лигаза АДҚ түзетін және аланалаланин синтетазы Бұл фермент d-аланин метаболизміне қатысады және пептидогликан биосинтезіне фосфат және D-циклозерин бұл ферментті тежейтіні белгілі D-аланиннің N-терминалды аймағы - D-аланин лигазасы субстрат байланыстыруға қатысады, ал C-терминалы катализатор болып саналады tic domain
Құрылымдық зерттеулер: 2007 жылдың аяғында 1 фермалардың осы класына арналған 8 құрылым шешілді, PDB ену кодтары 1EHI, 1IOV, 1IOW, 2DLN, 2FB9, 2I80, 2I87, 2I8C
Әдебиеттер
^ Roper DI, Huyton T, Vagin A, Dodson G 2000 ж. «Клиникалық тұрғыдан энтерококктардағы ванкомицинге тұрақтылықтың молекулалық негізі: D-аланил-D-лактатты лигаттың VanA» Proc Natl Acad Sci USA 97 16: 8921–5 doi: 101073 / pnas150116497 PMC 16797 PMID 10908650
Қосымша оқу: Ito, E; Strominger JL 1962 «II уридин нуклеотидтеріндегі пептидтің ферментативті синтезі. Ферментативті синтез және D-аланил-D-аланинді қосу» J Biol Chem 237: 2696–2703
Neuhaus FC 1962 «D-Ala-D бойынша кинетикалық зерттеулер. -Al синтетазасы «Fed Proc 21: 229 - Heijenoort J 2001» бактериалды пептидогликандық мономерлі бактериялық қондырғының пайда болуындағы соңғы жетістіктер «Nat Prod Rep 18 5: 503-19-19 doi: 101039 / a804532a PMID 11699883» Бұл мақалада Pfam және InterPro IPR011127 қоғамдық доменнен алынған мәтінді қамтиды: Ферменттер: CO CS және CN EC 61-63
61: көміртек-оттегі
аминоцил тРНК синтетазасы - Аланин
Аргинин - Аспарагин - Аспартат - Цистеин - D-аланин - полифосфорибитол лигазы
глутамат - глутамин және глицин - гистидин және изолейцин - лейцин
Лизин - Метионин - Фенилаланин - Пролин - Серин - Треонин - Триптофан - Тирозин - Валин - 62: Көміртек-күкірт - сукцинил коэнзимі А синтетаза
Ацетил - CoA синтетазасы. Ұзын тізбек - май қышқылы - Коа-лигаза
63: Көміртек-Азот - Глутамин синтетазасы - Убикуитин лигазы
Каллин - Фон Гиппель – Линдау ісіктерін басатын құрал
UBE3A - Mdm2
Анафаза UBR1 - глутатион синтетазасы - CTP синтетазасы және аденилосукцинатты синтаза - аргининосукцинатты синтаза - холокарбоксилаза синтетазасы - GMP синтезі - аспарагин синтетазасы және карбамойл фосфатының синтетазасы
I
II - Глутамат - цистеин лигазасы

ферменттер
белсенділігі
белсенді сайт - байланыстыратын сайт
каталитикалық триада - оксианионды тесік
Ферменттің қозғалғыштығы - Каталитикалық тұрғыдан тамаша фермент - Коэнзим - Кофактор
Ферменттік катализ - Нормативті-құқықтық реттеу
Ферменттері - Ферменттер тобы - Ферменттер тобы - Ферменттердің тізімі - Кинетика - Ферменттік кинетика - Эди-Хофсти диаграммасы - Ханес-Вулф сюжеті - Lineweaver-Burk учаскесі - Майклис –Ментенетикалық кинетика - EC1 Oxidoreductases тізімінің түрлері
EC2 Transfera ses тізімі
EC3 гидролаздар тізімі
EC4 изомераздар тізімі
EC6 лигазалар тізімі
Молекулалық және жасушалық биология порталы
Бұл EC 63 ферментіне қатысты мақалалар - сіз көмектесе аласыз. Википедияны
v
e
арқылы кеңейтіңіз


D-alanine—D-alanine ligase

Random Posts

Body politic

Body politic

The body politic is a metaphor that regards a nation as a corporate entity,2 likened to a human body...
Kakamega

Kakamega

Kakamega is a town in western Kenya lying about 30 km north of the Equator It is the headquarte...
Academic year

Academic year

An academic year is a period of time which schools, colleges and universities use to measure a quant...
Lucrezia Borgia

Lucrezia Borgia

Lucrezia Borgia Italian pronunciation: luˈkrɛttsja ˈbɔrdʒa; Valencian: Lucrècia Borja luˈkrɛsia...